产品简介
PRO-seq（Precision Run-On Sequencing）是一种专门用于检测新生RNA（Nascent RNA）的技术，可通过捕获基因组中正在活跃转录的RNA聚合酶复合物，从而实现即时转录活动的单核苷酸分辨率定位，直接反映基因转录起始、暂停、延伸、终止等动态过程，在时间分辨率上更全面展示转录调控。
实验流程
分析内容
深碳优势
a. 实验流程自主研发，特殊提核方式有效捕获新生RNA，单碱基分辨率，精准识别转录模式。
b. 不限物种及组织类型，非模式物种执行经验丰富。
c. 专利保障，分析体系完善，提供全面的分析内容与多组学联合应用，一站式服务辅助文章产出。
送样建议
a. 组织或细胞液氮速冻后干冰寄送。
b. 不同类型样本推荐送样量如下：
专利及参考文献
1.一种去除高丰度RNA的测序文库及其构建方法。董志诚; 朱家富; 刘敏。中国专利：CN112680797A，2021-04-20。
2. Kwak H, Fuda N J, Core L J, Lis J T. Precise maps of RNA polymerase reveal how promoters direct initiation and pausing[J].Science,2013,339(6122):950-953.
转录因子拮抗作用调控胚胎干细胞状态异质性
期刊：Molecular Cell
研究目的：阐明转录因子拮抗作用塑造干细胞异质性的分子机制，揭示动态增强子调控下细胞状态波动的形成原理。
实验设计：以胚胎干细胞为材料进行体外常规培养；分别敲除Klf4与Zfp281转录因子，对转录因子结合位点进行突变处理；利用ATAC-seq及PRO-seq等技术，对比不同处理下基因表达与细胞状态的差异。
主要结果：胚胎干细胞（ESC）的状态异质性并非随机波动，而是 由转录因子（TF）拮抗在增强子层面主动调控的结果。 以Klf4–Zfp281、Nanog–OTX2为代表的拮抗对，通 过在差异活性转录增强子（DATEs)上驱动对立的染色 质与转录程序，产生连续的细胞状态谱，并控制状态转 换动力学，为发育稳健性与谱系选择提供分子基础。
参考文献：
1.Judson R L, Farmery J H, Smith A D, et al. Transcription factor antagonism regulates heterogeneity in embryonic stem cell states[J]. Molecular Cell,2022,82(17):3229-3245.
